穆里尼奥在曼联的冠军：2016年英格兰社区盾冠军、2016-2017赛季英格兰足球联盟杯冠军、2016-2017赛季欧罗巴联赛冠军。
2016年5月27日，穆里尼奥正式成为曼联主帅。执教球队的首个赛季是穆里尼奥的高光时刻，尽管联赛表现不佳，但是穆帅2016-2017赛季率队拿到了联赛杯、欧罗巴联赛和社区盾的迷你三冠王，成为曼联队史上首位在执教球队的第一个赛季就赢得重要赛事冠军的主教练。赛季，穆帅麾下的曼联拿到了联赛亚军和足总杯的亚军。
2018-19赛季，曼联战绩不佳，尽管欧冠小组顺利出线，但前17轮英超联赛过后，曼联仅拿到了26分，平了自1990-91赛季以来队史同期的最低积分，也是曼联在英超时代的同期最差开局。糟糕的战绩成为了穆帅下课的导火索。2018年12月，球队在客战利物浦的比赛中破纪录地被对手狂射36脚并以1-3的比分失利，赛后穆里尼奥下课。
穆里尼奥执教曼联期间，总计在各项赛事中带队共征战144场比赛，取得了84胜32平28负的战绩，胜率为58.3%。
