Ubuntu下的软件安装–staden

最近从Windows迁到Ubuntu,其中很多软件都不一样了。

一一更新,发现以很多软件的功能不比windows差,甚至更强,但是要熟悉起来要花不少的时间。在安装的过程,google了很多文章介绍,但是经常是一些过期的文章,针对过期的版本,或者过期的操作系统,看了以后安装了,结果反而是不对的。非常的遗憾。

所以找资料的时候,要看好是版本,系统,或者有没有更全面的文章。

我的系统是Ubuntu 7.10先列一下我安装的软件列表:综合性的软件有以下的:openoffice.orgGIMPDIApidginemacsmysqlpdfeditacrobat reader综合性软件大部分安装都很顺利,,其中pidgin好象是自己编译的。其它都是sudo apt-get install xxxx

生物专业的软件:bioperlemboss(Jemboss)staden packageblastclustalRtexLive2007(kile)emacs其中texLive是以前下的,在windows下安装用的是同一张光盘。

要注意的是emboss和staden二个软件。

其中emboss的安装,因为需要Jemboss所以下了以后在jemboss的文件夹里有安装文件的。在EMBOSS-5.0.0/jemboss/utils下有一个叫install-jemboss-server.sh的文件,安装一步一步下来就行了。每一步的参考在jemboss的上有介绍。

staden其实是不用安装的。只要下载了就可以直接运行,不过要设置运行的时选项。

不敢接受失败的人,往往是那些追求完美的人,

Ubuntu下的软件安装–staden

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