Ubuntu 11.04 下安装R

方法1

在Ubuntu软件中心搜索 r-base 直接安装

或者

添加源,然后通过apt-get安装:

sudoapt-getinstallr-base

——————————————————

方法2

下载R的源码包(),比如:R-2.13.0.tar.gz

解压:

tar-zvxfR-2.13.0.tar.gz

配置:

cdR-2.13.0./configure–prefix=/home/xxx/R–enable-R-shlib

prefix设置R的安装路径,enable-R-shlib可以保证lib目录下的动态库能够共享

如果提示G77错误

sudoapt-getinstallbuild-essentialsudoapt-getinstallgfortran

如果提示错误:configure:error:–with-readline=yes(default)…

sudoapt-getinstalllibreadline6-dev

如果提示错误:configure:error:–with-x=yes(default) and X11…

sudoapt-getinstalllibxt-dev

安装:

makemakeinstall

link到bin目录下:

cd/binsudoln-sv/home/xxx/R/bin/R

至此安装完毕。

——————————————————

安装pkg:

终端下输入:R

source(“http://www.bioconductor.org/biocLite.R”)biocLite()

默认将安装一下几个包

affy affydata affyPLM

annaffy annotate Biobase

Biostrings DynDoc gcrma

genefilter geneplotter hgu95av2

limma marray matchprobes

multtest ROC vsn

xtable affyQCReport

如果需要Bioconductor上别的包的话,,可以使用

biocLite(c(“pkg1”, “pkg2”))

如:

biocLite(c(“copula”,”pspline”))

安装CRAN上的包

install.packages(c(“pkg1″,”pkg2”))

来安装(pkg1和pkg2为需要安装的包)。——————————————————

编辑器:

1.直接shell。终端输入R,就进入R命令行了。

2.安装GUI:Rcmdr

sudoapt-getinstallr-cran-rodbcsudoapt-getinstallr-cran-rcmdr

运行R后,library(Rcmdr)就可以打开图形界面。

3.用emacs

通过软件中心搜索emacs ess直接安装。打开emacs

M-x R

输入R的路径,就进入R编辑模式了。

emacs中可以用下面三条指令把正在编辑的程序文本送给R运行:

C-c C-n 当前行C-c C-c 当前段C-c C-b 当前整个文件

人之所以能,是相信能。

Ubuntu 11.04 下安装R

相关文章:

你感兴趣的文章:

标签云: