方法1
在Ubuntu软件中心搜索 r-base 直接安装
或者
添加源,然后通过apt-get安装:
sudoapt-getinstallr-base
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方法2
下载R的源码包(),比如:R-2.13.0.tar.gz
解压:
tar-zvxfR-2.13.0.tar.gz
配置:
cdR-2.13.0./configure–prefix=/home/xxx/R–enable-R-shlib
prefix设置R的安装路径,enable-R-shlib可以保证lib目录下的动态库能够共享
如果提示G77错误
sudoapt-getinstallbuild-essentialsudoapt-getinstallgfortran
如果提示错误:configure:error:–with-readline=yes(default)…
sudoapt-getinstalllibreadline6-dev
如果提示错误:configure:error:–with-x=yes(default) and X11…
sudoapt-getinstalllibxt-dev
安装:
makemakeinstall
link到bin目录下:
cd/binsudoln-sv/home/xxx/R/bin/R
至此安装完毕。
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安装pkg:
终端下输入:R
source(“http://www.bioconductor.org/biocLite.R”)biocLite()
默认将安装一下几个包
affy affydata affyPLM
annaffy annotate Biobase
Biostrings DynDoc gcrma
genefilter geneplotter hgu95av2
limma marray matchprobes
multtest ROC vsn
xtable affyQCReport
如果需要Bioconductor上别的包的话,,可以使用
biocLite(c(“pkg1”, “pkg2”))
如:
biocLite(c(“copula”,”pspline”))
安装CRAN上的包
install.packages(c(“pkg1″,”pkg2”))
来安装(pkg1和pkg2为需要安装的包)。——————————————————
编辑器:
1.直接shell。终端输入R,就进入R命令行了。
2.安装GUI:Rcmdrsudoapt-getinstallr-cran-rodbcsudoapt-getinstallr-cran-rcmdr
运行R后,library(Rcmdr)就可以打开图形界面。
3.用emacs
通过软件中心搜索emacs ess直接安装。打开emacs
M-x R输入R的路径,就进入R编辑模式了。
emacs中可以用下面三条指令把正在编辑的程序文本送给R运行:
C-c C-n 当前行C-c C-c 当前段C-c C-b 当前整个文件
人之所以能,是相信能。