黑鲨3S预装的是JOYUI 12系统，基于MIUI 12 深度定制，包含了米柚光锥动效和通感可视化设计、超级壁纸、隐私保护、贴心小功能等一系列基础体验优化。在游戏体验部分JOYUI 12也有许多贴心的辅助功能，帮助玩家在游戏操控和视觉体验上有更多玩法。全新的畅玩投屏功能，仅通过一根USB3.0数据线将手机与电脑连接，即可实现在PC屏幕上投屏游戏画面，同时还可使用PC的键盘鼠标进行游戏，仅有40ms的低时延表现，让玩家畅享PC级游戏体验。
值得一提的是，得益于腾讯黑鲨游戏手机3S独立的显示芯片，JOYUI12允许玩家在游戏中自定义画面效果，包含色调、饱和度、对比度、锐度和暗部增强等参数。针对部分游戏，例如《和平精英》JOYUI12精心调教了一组狩猎模式显示参数，有效增强游戏中的显示效果，帮助玩家快速发现伏地魔，赢得战机。除此之外自定义陀螺仪、游戏宏、弹幕通知、黑鲨时刻等一系列实用游戏功能辅助，真正实现游戏打得爽、玩得尽兴。
