linux系统gaussian运行命令
linux系统gaussian运行命令详细介绍
在 Linux 系统上运行 Gaussian 软件,你可以使用以下基本命令。
1. 提交单任务作业
如果你有一个 Gaussian 输入文件(通常扩展名为 .gjf 或 .com),例如 example.gjf,可以使用以下命令来运行它:
bash
g09 example.gjf example.log
在上述命令中:
g09是 Gaussian 09 的可执行命令。如果你使用的是 Gaussian 16,则应使用g16。< example.gjf表示将example.gjf文件的内容作为输入传递给 Gaussian 程序。> example.log表示将程序的输出结果重定向到example.log文件中。
2. 使用脚本批量提交作业
若你有多个 Gaussian 作业需要运行,可编写一个脚本来批量提交。以下是一个简单的示例脚本:
bash
@}"
.gjf}.log"
g09 " "
"
把上述脚本保存为 submit_jobs.sh,然后赋予执行权限并运行:
bash
+x submit_jobs.sh./submit_jobs.sh
3. 使用作业调度系统(如 Slurm)
在集群环境中,通常会使用作业调度系统来管理作业。以下是一个使用 Slurm 提交 Gaussian 作业的示例脚本:
bash
module load gaussian
g16 input.gjf output.log
9912345678910111213#!/bin/bash
module load gaussian
g16 < input.gjf > output.log
把上述脚本保存为 gaussian_slurm.sh,然后使用以下命令提交作业:
bash
sbatch gaussian_slurm.sh
912sbatch gaussian_slurm.sh
以上就是在 Linux 系统上运行 Gaussian 的常用命令和方法,你可根据实际情况进行选择和调整。